Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF40AO75400 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms