Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms