Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP104O60308 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP104O60308 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms