Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ2O43526 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms