Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COCHO43405 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COCHO43405 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COCHO43405 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COCHO43405 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COCHO43405 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COCHO43405 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COCHO43405 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COCHO43405 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms