Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI1O43347 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI1O43347 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSI1O43347 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI1O43347 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI1O43347 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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