Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI2O43237 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI2O43237 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms