Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF1O14829 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms