Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP23O00161 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms