Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E9PBE3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E9PBE3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E9PBE3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E9PBE3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E9PBE3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E9PBE3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms