Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4E1Z4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
B4E1Z4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms