Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DGG1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DGG1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DGG1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DGG1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms