Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms