Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1CA8MV81 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms