Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms