Protein–RNA interactions for Protein: A8MPP1

DDX11L8, Putative ATP-dependent RNA helicase DDX11-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11L8A8MPP1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11L8A8MPP1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX11L8A8MPP1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms