Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOBPA7XYQ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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