Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf47A7E2U8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C4orf47A7E2U8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
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