Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP27XA6NNY8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms