Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HELTA6NFD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms