Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L4A6NCW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP17L4A6NCW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms