Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf170A2RU37 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms