Protein–RNA interactions for Protein: A1L188

NDUFAF8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF8A1L188 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NDUFAF8A1L188 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms