Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQJ8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms