Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A4Q9Y6R1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms