Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL42Q9Y6G3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL42Q9Y6G3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms