Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms