Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNX13Q9Y5W8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms