Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF3C3Q9Y5Q9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms