Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHLDA3Q9Y5J5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms