Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms