Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARP1Q9Y4F1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARP1Q9Y4F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms