Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms