Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R4

NEU2, Sialidase-2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU2Q9Y3R4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU2Q9Y3R4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU2Q9Y3R4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms