Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1Q9Y3L3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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