Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms