Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms