Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms