Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQSEC3Q9UPP2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQSEC3Q9UPP2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms