Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIZ1Q9ULV3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CIZ1Q9ULV3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms