Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPCN1Q9ULQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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