Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms