Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM5BQ9UGL1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
KDM5BQ9UGL1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms