Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEF1Q9UBV8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEF1Q9UBV8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms