Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNMT3BQ9UBC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms