Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP28Q9P2N2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms