Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL9Q9P2J3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL9Q9P2J3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms