Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNKQ9P0W0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms