Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMCD1Q9NZU5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms