Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS1Q9NYS0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms